蛋白组学侧重于蛋白质的表达量变化，但这一策略并不能全面揭示蛋白质的“活性状态”或“功能状态”。例如，一种蛋白即使表达量不变，其活性却可能因翻译后修饰或共价修饰而发生显著改变。化学蛋白组学定量分析（Chemical Proteomics） 提供了应对这一挑战的全新策略。通过引入具有反应特异性的化学探针，研究者能够选择性地标记、富集并定量分析活性状态下的目标蛋白群体，从而揭示蛋白质在动态生命过程中的真实功能。

一、化学蛋白组学的核心原理

1、反应特异性探针（Activity-Based Probes, ABPs）

ABPs 是化学蛋白组学的核心工具，通常由三部分构成：

（1）识别基团：特异性结合靶标蛋白活性位点

（2）反应基团：与蛋白形成共价键，确保稳定结合

（3）标记基团：如生物素、荧光团或同位素标签，用于富集与检测

这种设计使得 ABPs 能够在复杂样本中实现对活性蛋白的高选择性标记，从而绕开蛋白组学对表达量的依赖。

2、Click Chemistry 与富集策略

为了提高定量精度和灵敏度，现代化学蛋白组学常结合 Click Chemistry 实现探针标记后的快速接枝，进一步结合链霉亲和素磁珠或抗体富集策略，实现低丰度蛋白的高效回收。

二、化学蛋白质组学定量分析策略概览：从探针设计到质谱数据

化学蛋白组学的定量分析通常可分为以下几个关键步骤：

1、探针设计与样本处理

探针的选择取决于研究目标。例如：

（1）丝氨酸水解酶类酶：使用氟磷酸酯类探针

（2）半胱氨酸蛋白酶：常用烷基化基团如乙炔酰胺

（3）蛋白酪氨酸磷酸酶：需设计对位烷基苯膦酸类探针

将探针加入细胞裂解液或活细胞培养液中处理，使其与靶标蛋白特异反应。

2、探针-蛋白复合物富集

采用Click Chemistry将探针与生物素或荧光标签偶联，随后利用链霉亲和素磁珠富集目标蛋白。百泰派克生物科技在此环节采用高通量自动化富集平台，显著提升样本处理的一致性与回收率。

3、蛋白酶解与定量标记

富集后的蛋白经胰蛋白酶消化，可使用TMT/iTRAQ 等同位素标记方法进行多条件比较，也可采用 label-free 策略用于特定体系。

4、LC-MS/MS 检测与数据分析

使用高分辨质谱（如 Orbitrap Exploris 480）进行多肽定性与定量分析，配合 MaxQuant、Proteome Discoverer 或专有算法分析蛋白活性变化。

三、从样本类型出发构建最佳分析策略

百泰派克生物科技优势：从探针优化到高通量定量

在百泰派克生物科技，我们提供一站式化学蛋白组学服务，包括但不限于：

• 反应特异性探针的定制设计与合成
• 自动化样本富集与酶解平台
• 多策略定量方法（TMT、Label-Free、SILAC）
• 高分辨 Orbitrap 质谱平台（Exploris、Fusion Lumos）
• 专业生信团队进行活性蛋白谱挖掘与可视化分析

借助这些策略，我们帮助客户从复杂背景中提取“真正功能蛋白”的信息，加速新药靶点筛选、生物标志物发现与机制研究。随着生物医学研究从“表达组”迈向“功能组”，化学蛋白组学正成为不可或缺的利器。通过精准的化学探针标记和高通量质谱分析，研究者得以在原始样本中锁定“活跃状态”的关键蛋白，推动从基础机制到药物发现的系统升级。

如您正在探索蛋白活性状态、靶点筛选或机制解析，欢迎联系百泰派克生物科技，我们将以专业的技术支持与定制化服务，助力您的科研突破。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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